A prática esportiva melhora o humor, a concentração, estimula a liderança e aumenta o desempenho escolar. Ciente disso, o Colégio Padre Eustáquio cumpre o compromisso de ofertar a seus alunos atividades físicas, no cotidiano das aulas de Educação Física e nas Olimpíadas Estudantis.
Além dos jogos e competições internas, o Colégio Padre Eustáquio, também, propicia aos seus alunos a participação em competições intercolegiais como FEEMG e ANEC. Os treinamentos ocorrem em horários diferenciados para os interessados em participar das equipes competitivas da Escola, como atividades extracurriculares.
Em 2019, o time de Handebol Feminino Sub-17 foi medalha de prata nos jogos da ANEC e o time de Basquete Masculino Sub-17, campeão, pelo segundo ano consecutivo.